Главные герои аниме — это Ред (жизнерадостный мальчик, живущий в городе Паллет Таун региона Канто) и Грин (внук знаменитого исследователя покемонов профессора Окидо). Вместе им предстоит бороться с Командой R, могущественной преступной организацией, и пройти путь становления сильнейшими мастерами покемонов.
Аниме основано на оригинальной игре от Nintendo «Покемон: Красное и Зелёное».