Природные катаклизмы опустошили планету Зи, уничтожив почти все живое. Тысячу лет спустя люди постепенно восстановили цивилизацию, спасая древних зоидов с помощью дайвинга и добычи полезных ископаемых. В деревне, главной реликвией которой является гигантский меч, которому они поклоняются как священному символу. Мальчик-подросток обнаруживает древнего зоида, похожего на лигра, во время глубоководной спасательной операции. Внезапно на деревню нападают скелетообразные биозоиды, намеревающиеся украсть мощный генератор, расположенный в деревне. Наш герой-подросток пробуждает Лигра и обнаруживает, что священный меч города - это оружие лигра, вместе они сражаются с таинственными биозоидами. По крайней мере, пока...