Спустя два года после событий первого сезона Дэн и его друзья наслаждаются тихой и спокойной жизнью. Внезапно перед Дэном открывается портал, из которого прибывает Драго. Драго просит своего напарника помочь ему спасти Новую Вестрою от захвативших его родину вестов. Прибыв на Новую Вестрою, Дэн и последовавший за ним Маручо встречают бойцов Фронта Освобождения Бакуган: бойца Сабтерры Миру, бойца Даркуса Эйса и бойца Хаоса Бэйрона. Вместе с ними наши главные герои начинают противостояние шести сильнейшим бойцам среди вестов — вексам.