Несмотря на принятие постановления "Билл", вводящего комендантский час для несовершеннолетних и регулирующего доступ в Интернет, молодежь продолжает бороться за свою свободу, используя разные методы. Одна такая группа борцов за свободу находится в Токио. Они называют себя "SIRRUT". Группа решает взять в плен Фумито Нанахару, человека, который имеет большое влияние на политический мир и тайно контролирует Токио. Используя интернет в качестве оружия, группа больше узнает о Фумито и о "Башне", тайной организации, которая занимается экспериментами над людьми.
Когда члены "SIRRUT" попытались устроить засаду в метро с целью разоблачить "Башню", загадочные существа вдруг появляются и нападают на пассажиров. Во время этой бойни появляется Сая - молодая девушка, которая использует катану, чтобы убить монстров. Это та самая Сая, которая многое потеряла после ужасающих происшествий в провинции Укасима. Какие эксперименты проводят Фумито и "Башня", и сможет ли Сая отомстить Фумито?
Финальная битва начинается!