Меньше года спустя после событий телесериала «Макросс 7» Басара Нэкки покидает группу Fire Bomber и отправляется на планету Зола. Там он встречает девушку по имени Эльма Хойли, большую фанатку Fire Bomber. Именно на этой планете ему предстоит снова прибегнуть к силе своей Спиритии — на этот раз для того, чтобы остановить армию браконьеров и отца Эльмы, Грэхема, которые намерены убить стаю космических китов, проходящую через эту звёздную систему.